В 1998 году в топливную структуру холдингового типа объединилось порядка 30 компаний Санкт-Петербурга и Ленинградской области. В их числе организации, управляющие сетями автозаправочных станций, оказывающие услуги по хранению нефтепродуктов, проведению химических анализов, пожарной профилактике, оптовые фирмы, автотранспортные предприятия, строительные и проектные организации, и другие компании, связанные с нефтепродуктообеспечением. Их профиль деятельности позволил создать замкнутую технологическую цепочку движения нефтепродуктов и организации их сбыта. Иными словами Петербургская топливная компания самостоятельно обеспечивает процесс движения топлива от нефтеперерабатывающего завода до бака автомобиля, а также проектирование, строительство АЗС, производство асфальта, бордюрного камня, тротуарной плитки, металлоконструкций и так далее. Центром управления является ЗАО «Петербургская топливная компания». Именно ее акционеры и Совет директоров принимают стратегические решения, обеспечивающие активное развитие компании. Решение тактических вопросов возложено на Директорат.
Высшим органом управления Закрытого акционерного общества «Петербургская топливная компания» является общее собрание акционеров, которое действует в соответствии с Федеральным законом «Об акционерных обществах» и Уставом Общества.
Совет директоров - коллегиальный орган управления ЗАО "ПТК", состоящий из 5 человек, избираемых общим собранием акционеров на срок до следующего годового общего собрания акционеров в порядке, установленном действующим законодательством об акционерных обществах и Уставом.
Директорат - это объединение топ-менеджеров разнопрофильных компаний, входящих с структуру ПТК, благодаря которым холдинг и является самодостаточным. Директоратом принимаются любые стратегические и тактические решения, не относящиеся к компетенции собрания акционеров, совета директоров и генерального директора.